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林淑端从美国返回台湾从事研究初期，学界普遍对 RNA 降解不感兴趣，但他仍埋首其中。1996 年于《美国国家科学院院刊》发表论文，独立分离出 RNA 降解体，并鉴定主要蛋白为 RNase E、PNPase、RhlB helicase 和 Enolase，是全球首先发现这项成果的两组研究团队之一。
2001 年首度发现 RNA 降解体的位置是位于细菌内膜，2004 年与国际团队共同发现 RNA 降解在基因表达过程中的功能。
同时也研究细菌中的非编码小 RNA（non-coding small RNA），发现细菌会利用其调控防御病毒感染和引发疾病，并研究这些小 RNA 的裁切与降解。
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加拿大官方认定《啊，加拿大》的英法两个版本。有时在演唱时会将英法双语版本混合演唱。
官方法文歌词是四段诗的第一段，从开始到现在无变。
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* 美国驻查德大使（2004年6月—2007年7月）
* 美国驻伊拉克大使馆公使兼经济转型协调官（2008年—2009年7月）
* 美国驻日大使馆经济科学公使（2009年11月—）
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